Durante su administración como Párroco del Señor de la Misericordia de Ocotlán, Monseñor Rafael Martínez puso en práctica diversas obras sociales, como la construcción del nuevo edificio del Hogar de Ancianos, en la colonia Riberas de Zula. Fundó un Orfanato para recibir a niños sin tutela, también creó la Estancia Infantil “Pascual Nuñez” con el fin de apoyar a las madres y padres trabajadores. Tuvo a bien fundar el “Banco de Alimentos” del que se beneficiaban cientos de empleados de las fábricas Celanese, Nestlé, Industrias Ocotlán e instituciones parroquiales.
Fortaleció el patronato del Hospital San Vicente, dotándolo de autoridad jurídica, así como del patronato de la Escuela Hogar y de Hogares Fraternales. Formó parte del Consejo de Gobierno del Ayuntamiento de Ocotlán y miembro del Consejo de Vialidad de los cuales contribuyó en el desarrollo de la ciudad de Ocotlán.
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